11 мая 2020

Что можно узнать о коронавирусе SARS-CoV-2 по его геному и как он мутирует? Рассказывает биоинформатик

Как коронавирус SARS-CoV-2 проникает в клетки человеческого организма, почему его появление связывают с летучими мышами и панголинами и насколько быстро он мутирует?

На эти и другие вопросы на вебинаре, организованном Фондом инфраструктурных и образовательных программ (Группа РОСНАНО) и «Бумагой», ответил старший научный сотрудник лаборатории системной биологии старения в Медицинской школе Гарварда и МГУ и один из авторов нашей научной рассылки Александр Тышковский.

«Бумага» публикует основные тезисы из его выступления и письма.

Александр Тышковский

Старший научный сотрудник лаборатории системной биологии старения в Медицинской школе Гарварда и МГУ

Из чего состоит коронавирус и как он присоединяется к нашим клеткам?

Вирус — это простая субстанция: некая упаковка, внутри которой находится генетическая информация в виде ДНК или, как в случае с коронавирусом SARS-CoV-2, РНК.

Кроме РНК у SARS-CoV-2 есть липидная оболочка и белки. Визитная карточка коронавируса — белок-шипик и тот фрагмент на нем, которым он связывается с рецептором на поверхности наших клеток. Именно эта часть отличает наши вирусы от вирусов животных, которые не могут нас заражать.

В РНК нового коронавируса около 30 тысяч букв. В генетической информации зашифровано устройство вируса, и попадая в клетку, именно она помогает ему размножаться. Кроме того, генетическая информация отличает один вирус от другого, определяет, с каким из них мы имеем дело, а также дает ответы о происхождении вируса.

Почему гипотеза о том, что SARS-CoV-2 был создан учеными, неверна?

Самая известная гипотеза искусственного происхождения вируса, растиражированная в прессе, — статья 2015 года, в которой описано, как ученые, в том числе из лаборатории Уханьского института вирусологии, создали химеру из двух коронавирусов.

Первым из используемых в этом эксперименте вирусов был вирус атипичной пневмонии 2003 года, довольно близкий родственник нынешнего коронавируса, а вторым — вирус из летучих мышей, который человеческие клетки не заражает. В ходе исследований ученым удалось вставить белки-шипики одного вируса в вирусную частицу другого. Фактически они объединили их последовательности РНК, в результате чего получился смешанный вирус.

Проверить, насколько созданный учеными вирус похож на SARS-CoV-2, можно по генетической информации, собранной в базе данных BLAST. Сходство — 80 %. Кажется, много, но примерно такой же процент сходства у ДНК человека и какой-нибудь рыбы. В эволюционном смысле это очень далеко.

Более того, если мы еще немного поработаем с этой базой данных, то увидим, что на сегодняшний день нет ни одного вируса, который бы совпадал с нашим хотя бы на 97 %. Поэтому очень маловероятно, что ученые могли создать SARS-CoV-2 из известных сегодня вирусов.

Бумага
Авторы: Бумага
Если вы нашли опечатку, пожалуйста, сообщите нам. Выделите текст с ошибкой и нажмите появившуюся кнопку.
Подписывайтесь на «Бумагу» там, где вам удобно
Все тексты
Коронавирус в Петербурге
«Прогнозируем, что 8 ноября общепит не откроют». Как бары и рестораны отреагировали на локдаун в Петербурге, почему ждут продления ограничений и какой ущерб предсказывают
Роспотребнадзор: ограничения в Петербурге снимут, когда будет вакцинировано 80 % населения
Как во время локдауна будут работать торговые центры? Вот что говорят в правительстве Петербурга
В Петербурге осталось около 1700 свободных коек под COVID-19. Власти говорят, что это «эквивалентно трем пустующим больницам»
Как растет число заболевших и умерших из-за коронавируса в Петербурге — показываем на графиках
Новые тексты «Бумаги»
На «Бумаге» — премьера клипа «Научи меня жить» от группы «Простывший пассажир трамвая № 7»
От хюгге-кэмпа до экофермы: блогеры рекомендуют необычные места для путешествия по Ленобласти
Чем технология 5G будет полезна экономике и почему вокруг нее столько страхов? Рассказывает кандидат технических наук
На Рубинштейна постоянно проходят уличные вечеринки, где веселятся сотни людей. Местные жители жалуются на шум, а полиция устраивает рейды
Как проходило голосование по поправкам в Петербурге: вбросы бюллетеней, коронавирус у членов комиссий и участки во дворах
Четвертая волна коронавируса
«Прогнозируем, что 8 ноября общепит не откроют». Как бары и рестораны отреагировали на локдаун в Петербурге, почему ждут продления ограничений и какой ущерб предсказывают
Роспотребнадзор: ограничения в Петербурге снимут, когда будет вакцинировано 80 % населения
Что нужно знать о коронавирусных ограничениях в Петербурге. Недельный локдаун, QR-коды, вакцинация и маски
В Петербурге осталось около 1700 свободных коек под COVID-19. Власти говорят, что это «эквивалентно трем пустующим больницам»
Петербургская ВШЭ перевела студентов на дистанционное обучение — до конца года
Как меняется Петербург
В Кронштадте за 480 миллионов рублей выставили на продажу бывший военный завод. Его предлагают приспособить под гостиничный комплекс
Намывы — это зло или благо? Эксперты рассуждают, стоит ли дешевое жилье проблем с экологией и инфраструктурой
В Петербурге закрылось Bio My Bio — заведение со здоровой едой от Матильды Шнуровой
«Благотворительность уже прорастает отовсюду». Директор «Ночлежки» — о кафе в центре Петербурга, где бывшие бездомные будут обучаться новым профессиям
Рядом с «Лахта Центром» появится оздоровительный термальный комплекс за 450 млн рублей
Научпоп
Рецепторы, глобальное потепление и экономика труда. Главное о научных исследованиях нобелевских лауреатов — 2021
Космический туризм, астрономия и облачные технологии. Присоединяйтесь к нашему фестивалю Science Bar Hopping в Москве!
Петербургские археологи нашли геоглиф в виде быка в Тыве. Рассказываем, что это и почему находку называют уникальной
Откуда берутся слухи про чипирование, как фейки о бесплатных лекарствах рекламируют БАДы и можно ли зарабатывать на фактчекинге в России? Рассказывает сооснователь Fakecheck
Мы проводим научный фестиваль «Кампус» — офлайн! Приходите на лекции о том, как устроен интернет 💻 И поспешите, билетов не очень много
Вакцинация от коронавируса
Роспотребнадзор: ограничения в Петербурге снимут, когда будет вакцинировано 80 % населения
В «Галерее» второй день стоят огромные очереди на вакцинацию. Там прививают по 600–700 человек в сутки
В Петербурге задержали пятерых медиков, которые организовали фиктивный пункт вакцинации при университете имени Павлова
Власти Петербурга расширят сеть пунктов вакцинации. Привиться можно будет еще в двух ТЦ
Как получить QR-код в Петербурге? И что делать, если с его выдачей возникла проблема?
Коллеги «Бумаги»
Кто реально победил на выборах в Госдуму? В чем не правы противники «Умного голосования»? Как были устроены фальсификации?
Как протест против ввоза мусора из Москвы пробудил в ярославцах интерес к экологическим проблемам
Как «Независимая ассоциация врачей» отговаривает россиян прививаться
Гид по пригородам Петербурга
Прогулки с видом на реку, 100-летняя ГЭС и краеведческий музей в доме инженера — приезжайте в Волхов
В Петяярви — маршрут для долгой бодрой прогулки и идеальные места для пикников. Осмотрите заброшенную финскую ГЭС с водопадом и лесные озера
В Гатчине — не только дворец и парки. Осмотрите замок мальтийских рыцарей, деревянную дачу с башней и старинную слободу, где жили егеря
В Орехове — самая высокая точка Карельского перешейка, заказник с дикими зверьми и озера. Летом в полях цветет рапс и пасутся лошади
В Лебяжьем — «кладбище поездов», столетние дома и военные форты. Прогуляйтесь по местам писателя Бианки и останьтесь до вечера, чтобы увидеть закат над заливом
Подкасты «Бумаги»
Зачем мы участвуем в онлайн-флешмобах и к чему они могут привести? В подкасте «Все мы медиа» обсуждаем #MeToo, флаги на аватарках и солидарность в соцсетях
Как спасти планету от мусора? Придумываем варианты во время мозгового штурма: от геймификации до новой экономики
«Нахрен все эти деньги, открываем бар!». Каково запустить бизнес своей мечты — и закрыть его
Вместе со школы❤️ Выпуск про первые отношения и неловкие романы
«Твой умный кореш»: слушайте подкаст «Бумаги» — с историями про безумный автостоп, жизнь с пятью детьми и отказ от алкоголя
К сожалению, мы не поддерживаем Internet Explorer. Читайте наши материалы с помощью других браузеров, например, Mozilla Firefox или Chrome.